Proteomica: ¿ la ciencia del futuro?

by Dr. Alfonso Jaramillo (Lab. Biochimie - Ecole Polytechnique)

Tuesday 30 Mar 2004, 12:00 → 13:00 Europe/Madrid

Sala Seminarios IFIC (Edf. Institutos de Investigación)

Proteinas, estabilidad y evolución: un paseo por el espacio de las secuencias. En estos últimos años, la biología ha comenzado a experimentar un drástico cambio debido a la explosión de datos experimentales a escala molecular, en particular los referentes a las proteínas. Dichos datos son susceptibles de ser analizados con modelos físicos y éstos se han llegado a usar con éxito para generar predicciones y concebir nuevas proteínas a partir de principios fisicoquímicos. Un gen codifica la información para generar una proteína, las cuales son las macromoléculas que generan la mayoría de las funciones en los organismos vivos. Las proteínas están compuestas por una secuencia de aminoácidos, cada uno formado por unos pocos átomos con una cierta disposición tridimensional. El número de secuencias o combinaciones posibles es enorme (20^300, para una proteína de 300 aminoácidos), aunque no todas estas combinaciones son relevantes. En este coloquio se describirá un método computacional para explorar el espacio de secuencias, generando las estructuras atómicas para cada proteína posible y calculando su energía libre. Se compararan las secuencias resultantes con las obtenidas experimentalmente, en parte gracias a los proyectos de secuenciación de genomas. Ello nos permitirá interpretar el papel jugado por cada aminoácido en la estabilidad de la proteína, así como su variabilidad en los distintos seres vivos. Nuestro método no sólo proporciona una comprensión de porqué ciertas secuencias han sido seleccionadas por la evolución natural, sino también sirve para crear nuevas proteínas con funciones específicas, tales como aplicaciones terapéuticas o nanotecnológicas.

Slides coloquio_0005_1.pdf